MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 12376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017909	A	6	6	609446	609451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017909	ATT	2	6	609470	609475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017909	TA	3	6	609476	609481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017909	A	6	6	609494	609499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017909	AAT	2	6	609508	609513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017909	A	7	7	609540	609546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017909	CTG	2	6	609597	609602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017909	AAG	2	6	609608	609613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017909	TAA	2	6	609787	609792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017909	CTA	2	6	609795	609800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017909	TAA	3	9	609816	609824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017909	AAGC	2	8	609831	609838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_017909	ATAA	2	8	609842	609849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017909	ATT	2	6	609853	609858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017909	ATC	2	6	609892	609897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017909	CCT	2	6	609932	609937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_017909	TGA	2	6	610009	610014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017909	A	6	6	610082	610087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017909	GT	3	6	610116	610121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017909	TTG	2	6	610125	610130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017909	CTC	2	6	610174	610179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017909	T	6	6	610352	610357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017909	AATA	2	8	610358	610365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017909	A	7	7	610405	610411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017909	TAG	2	6	610508	610513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017909	TTA	2	6	610551	610556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017909	TAT	2	6	610590	610595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017909	A	7	7	610604	610610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017909	TGAT	2	8	610622	610629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017909	GGC	2	6	610648	610653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017909	ATA	2	6	610672	610677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017909	A	6	6	610677	610682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017909	TAAA	2	8	610772	610779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017909	GAAA	2	8	610789	610796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017909	TGTA	2	8	610805	610812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017909	TTTACA	2	12	610866	610877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4037	NC_017909	T	7	7	610903	610909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017909	GTT	2	6	610919	610924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017909	A	7	7	610952	610958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017909	GGGA	2	8	611006	611013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017909	CTCC	2	8	611080	611087	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4042	NC_017909	AAAT	2	8	611171	611178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017909	TAA	2	6	611196	611201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017909	T	6	6	611292	611297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017909	A	7	7	611302	611308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017909	A	6	6	612519	612524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017909	AGT	2	6	612533	612538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017909	AGC	2	6	612550	612555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017909	CCT	2	6	612589	612594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_017909	T	6	6	612642	612647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017909	ATT	2	6	612658	612663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017909	TA	3	6	612705	612710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017909	AAAG	2	8	612721	612728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017909	TGG	2	6	613729	613734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017909	TA	3	6	613749	613754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017909	GAT	2	6	614959	614964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017909	GCTT	2	8	614984	614991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_017909	T	6	6	615030	615035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017909	TTAA	2	8	615051	615058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017909	TAAG	2	8	615074	615081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017909	A	6	6	615632	615637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017909	AATT	2	8	615639	615646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017909	TAAA	2	8	615649	615656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017909	T	6	6	620298	620303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017909	TAAAA	2	10	620310	620319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017909	TA	3	6	624609	624614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017909	AAT	2	6	624632	624637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017909	A	7	7	624675	624681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017909	AT	3	6	624700	624705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017909	TTTA	2	8	624706	624713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017909	CTA	2	6	625984	625989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017909	A	7	7	626002	626008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017909	TAAT	2	8	626034	626041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017909	A	7	7	626074	626080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017909	TAA	2	6	627265	627270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017909	T	6	6	627300	627305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017909	AAGT	2	8	627322	627329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017909	TTA	2	6	627376	627381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017909	TA	3	6	627384	627389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017909	AGT	2	6	627399	627404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017909	TA	3	6	627421	627426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017909	TTA	2	6	627494	627499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017909	TAA	2	6	627554	627559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017909	TA	3	6	627566	627571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017909	T	6	6	627584	627589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017909	ATT	2	6	627669	627674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017909	ATA	2	6	627690	627695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017909	TA	3	6	627694	627699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017909	TAA	2	6	627718	627723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017909	ATT	2	6	627761	627766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017909	TAA	2	6	627778	627783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017909	GGT	2	6	627788	627793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017909	AGA	2	6	627822	627827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017909	TAG	2	6	629046	629051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017909	TTA	2	6	629064	629069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017909	GCAA	2	8	629079	629086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_017909	GTT	2	6	629087	629092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017909	TAT	2	6	629115	629120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017909	AT	3	6	629119	629124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017909	GCT	2	6	629205	629210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_017909	AAGCT	3	15	629211	629225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_017909	TAA	2	6	629264	629269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017909	ATT	2	6	629537	629542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017909	AAT	2	6	630064	630069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017909	TAA	2	6	630077	630082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017909	ACT	2	6	630089	630094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017909	TGC	2	6	630095	630100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017909	T	6	6	630120	630125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017909	CTTGC	2	10	630195	630204	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4111	NC_017909	TC	3	6	630287	630292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_017909	TGTT	2	8	630296	630303	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017909	TTTG	2	8	630304	630311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017909	TAA	2	6	630315	630320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017909	TTA	2	6	632369	632374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017909	CTTT	2	8	632668	632675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_017909	A	7	7	632680	632686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017909	AAG	3	9	632689	632697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017909	TCTA	2	8	632725	632732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_017909	CAT	2	6	632736	632741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017909	TAT	2	6	632763	632768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017909	A	6	6	632807	632812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017909	AAG	2	6	634324	634329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017909	TTA	2	6	634338	634343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017909	AAT	2	6	634353	634358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017909	ATA	2	6	634383	634388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017909	AT	3	6	634443	634448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017909	A	6	6	634642	634647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017909	GCT	2	6	634650	634655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017909	AAT	2	6	634698	634703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017909	CAG	2	6	634810	634815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017909	ATG	2	6	634822	634827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017909	T	6	6	634952	634957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017909	GAT	2	6	634961	634966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017909	TGC	2	6	634987	634992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_017909	A	6	6	635033	635038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017909	GT	3	6	635052	635057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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